RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CARD17Q5XLA6 110 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TTI2Q6NXR4 508 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MTSS1LQ765P7 747 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SYT13Q7L8C5 426 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 YAF2Q8IY57 180 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 IL17RCQ8NAC3 791 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MCUQ8NE86 351 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 EDAQ92838 391 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 APOLD1Q96LR9 279 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 OR1F2PQ96R84 312 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MMS19Q96T76 1030 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CUEDC2Q9H467 287 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SLC32A1Q9H598 525 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PARVBQ9HBI1 364 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 VPS51Q9UID3 782 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SCOCQ9UIL1 159 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ELP1O95163 1332 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0J9YYE9 177 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM120BA0PK00 339 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 A6NL46 340 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 KBTBD13C9JR72 458 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJB6O75190 326 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 OR6B1O95007 311 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PCDH8O95206 1070 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 OR2C1O95371 312 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 AHSA1O95433 338 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CALCAP01258 141 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TRBC1P01850 177 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 LPLP06858 475 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 RARAP10276 462 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MSR1P21757 451 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SMSP52788 366 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PDE1AP54750 535 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PSMC5P62195 406 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SCRN1Q12765 414 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SLC13A2Q13183 592 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 AOC3Q16853 763 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MPPE1Q53F39 396 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SGO1Q5FBB7 561 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FAM131BQ86XD5 332 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF366Q8N895 744 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CCNYQ8ND76 341 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FAM122AQ96E09 287 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 RNFT2Q96EX2 444 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 LURAP1Q96LR2 239 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms