RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497675.2

FAAP20-214, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 4,478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-214ENST00000497675 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 USP7Q93009 1102 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PTGESO14684 152 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 KRT34O76011 436 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TFEBP19484 476 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CMPK1P30085 196 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CENPAP49450 140 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CDK7P50613 346 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 UBXN11Q5T124 520 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ICE2Q659A1 982 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SNAP91O60641 907 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 HLA-EP13747 358 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ETS1P14921 441 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NTSR1P30989 418 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 HPCAL1P37235 193 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 XKR6Q5GH73 641 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SYT12Q8IV01 421 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TMEM237Q96Q45 408 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 GDF3Q9NR23 364 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 COG5Q9UP83 839 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MT-CO1P00395 513 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 UQCRBP14927 111 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ESRRGP62508 458 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 AADACL2Q6P093 401 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 C16orf89Q6UX73 402 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LINGO1Q96FE5 620 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 GBP5Q96PP8 586 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LRRC19Q9H756 370 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ABI3Q9P2A4 366 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 VWA7Q9Y334 891 aa14.69□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NPC1O15118 1278 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 GNPDA1P46926 289 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CCR4P51679 360 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CREB5Q02930 508 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CTBP1Q13363 440 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CHSY3Q70JA7 882 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PIGVQ9NUD9 493 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LZTS1Q9Y250 596 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 INPP1P49441 399 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CCINQ13939 588 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 DHCR24Q15392 516 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 GBA3Q9H227 469 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 B4DGG1 531 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RING1Q06587 406 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 GKN2Q86XP6 184 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ARMC5Q96C12 935 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NDNQ99608 321 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF711Q9Y462 761 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 C9J4A7 227 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF217O75362 1048 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SYPP08247 313 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MYLK3Q32MK0 819 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RASIP1Q5U651 963 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 EMC10Q5UCC4 262 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 DEFB119Q8N690 84 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TBATAQ96M53 351 aa14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms