RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	APOLD1	Q96LR9	279 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	LGMN	Q99538	433 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1A2	Q9Y585	309 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0J9YYE9	177 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	LMO7DN	F2Z398	122 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246		H7C0C1	242 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	SPINT1	O43278	529 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT86	O43790	486 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBC1	P01850	177 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	CDKN2B	P42772	138 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5O	P48047	213 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	ACADVL	P49748	655 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59	1e-10	■□□□□ 9.3
TTLL3-231	ENST00000496246	RALGDS	Q12967	914 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	CNGA3	Q16281	694 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	PROX2	Q3B8N5	592 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	NXPE2	Q96DL1	559 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	DTD2	Q96FN9	168 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH19	Q9H159	772 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-231	ENST00000496246	CPED1	A4D0V7	1026 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TEAD1	P28347	426 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ETV3	P41162	512 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	XRCC4	Q13426	336 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf61	Q13536	156 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC14A2	Q15849	920 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PCSK7	Q16549	785 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PID1	Q7Z2X4	250 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL10	Q8N8L6	244 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GULP1	Q9UBP9	304 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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