RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489049.5

PDCD4-209, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 2

Gene PDCD4, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-209ENST00000489049 TLE2Q04725 743 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 EFEMP1Q12805 493 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 TAF10Q12962 218 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 SERINC3Q13530 473 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 RIPK1Q13546 671 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 RAB33AQ14088 237 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.69□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 RASSF3Q86WH2 238 aa6.69□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.69□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.69□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 TBX21Q9UL17 535 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 SLC7A4O43246 635 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 ACSL4O60488 711 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 PRAMEF11O60813 436 aa6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 FGF1P05230 155 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 URODP06132 367 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 BPGMP07738 259 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 OR4Q2P0C623 313 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 HLA-DPA1P20036 260 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 ELF1P32519 619 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 SERPINB5P36952 375 aa6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 ZBTB17Q13105 803 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 DUSP4Q13115 394 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 STX3Q13277 289 aa6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-209ENST00000489049 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 TAF12Q16514 161 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 MROH9Q5TGP6 573 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 FBXL22Q6P050 247 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-209ENST00000489049 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.68□□□□□ -1.34
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