RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 POC5Q8NA72 575 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 AVL9Q8NBF6 648 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 RFKQ969G6 155 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF503Q96F45 646 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA17Q96L03 361 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP7D2Q96T17 732 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 STRA6Q9BX79 667 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHL4Q9C0H6 718 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 GRPEL1Q9HAV7 217 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 UPB1Q9UBR1 384 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 AMFRQ9UKV5 643 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 PKP3Q9Y446 797 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 GAGE12BA1L429 117 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 UNC119BA6NIH7 251 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PRYO14603 147 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PROM1O43490 865 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 LPXNO60711 386 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 USP12O75317 370 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CSPG5O95196 566 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SPDEFO95238 335 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ONECUT2O95948 504 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 FPR3P25089 353 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TYK2P29597 1187 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 FMO4P31512 558 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC8A1P32418 973 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 BMPR1AP36894 532 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 RAD23AP54725 363 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TPTEP56180 551 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAMEP78395 509 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFAIP1Q13829 316 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 RABL3Q5HYI8 236 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ADALQ6DHV7 355 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 RTL10Q7L3V2 364 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRA1Q86SQ6 560 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CPXM2Q8N436 756 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CERS5Q8N5B7 392 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 POMGNT1Q8WZA1 660 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPH1Q92598 858 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SMARCE1Q969G3 411 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf74Q96LT6 269 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 FSD1Q9BTV5 496 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF747Q9BV97 191 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 APOL6Q9BWW8 343 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 EDEM3Q9BZQ6 932 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SH2D4AQ9H788 454 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ZWILCHQ9H900 591 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC28A3Q9HAS3 691 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 KLC4Q9NSK0 619 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 EHD3Q9NZN3 535 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SEL1LQ9UBV2 794 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 FZD4Q9ULV1 537 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 EPOPA6NHQ4 379 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 A8MXE2 369 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 DNM1LO00429 736 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TJP3O95049 919 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 AFPP02771 609 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CHRM2P08172 466 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PRR35P0CG20 571 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 NR4A1P22736 598 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 GSTM2P28161 218 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFS1P28331 727 aa5.82□□□□□ -1.48
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