RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPN5	P54829	565 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	AP1S1	P61966	158 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GRIK2	Q13002	908 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PGBD5	Q8N414	524 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KDM1B	Q8NB78	822 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIB3	Q96RU7	358 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SPON2	Q9BUD6	331 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NUF2	Q9BZD4	464 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PQ67	120 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PRRG1	O14668	218 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	UBD	O15205	165 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KERA	O60938	352 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TBX10	O75333	385 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	STC2	O76061	302 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RHOBTB1	O94844	696 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TBX18	O95935	607 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ESR1	P03372	595 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CHRNG	P07510	517 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CR2	P20023	1033 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ME2	P23368	584 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ACVRL1	P37023	503 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PTGER3	P43115	390 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCG1	P45844	678 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPA13	P48723	471 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CSNK1D	P48730	415 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A3	Q00325	362 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	BLMH	Q13867	455 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB33A	Q14088	237 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CUZD1	Q86UP6	607 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	LSMEM2	Q8N112	164 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ACD	Q96AP0	544 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ROPN1L	Q96C74	230 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TBATA	Q96M53	351 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758		H0Y626	953 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SDHD	O14521	159 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NEMP1	O14524	444 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	COCH	O43405	550 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SUPT7L	O94864	414 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	VNN2	O95498	520 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	FGF19	O95750	216 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CD1D	P15813	335 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NFKBIA	P25963	317 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	EPHA3	P29320	983 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ARRB2	P32121	409 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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