RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF12O95522 483 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CTPS1P17812 591 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 IRS1P35568 1242 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 EPHB1P54762 984 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MPPE1Q53F39 396 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP157Q5JU67 520 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 AGAP9Q5VTM2 703 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R36Q96LQ0 422 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MIPEPQ99797 713 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 DRC3Q9H069 523 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 FAM96AQ9H5X1 160 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 COG4Q9H9E3 785 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 IRAK3Q9Y616 596 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN14A8MX76 684 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PIGNO95427 931 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 KCNA5P22460 613 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN4P29074 926 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PLK1P53350 603 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TEAD2Q15562 447 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TECRLQ5HYJ1 363 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 POMKQ9H5K3 350 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC22O60826 627 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINA6P08185 405 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ALPIP09923 528 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 LPOP22079 712 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP8P85298 464 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 KRT72Q14CN4 511 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 RETSATQ6NUM9 610 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 LONP2Q86WA8 852 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 CPXM2Q8N436 756 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK15Q8TD08 544 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 TNKS2Q9H2K2 1166 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 TLR9Q9NR96 1032 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 KLC3Q6P597 504 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ALG9Q9H6U8 611 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC28Q9NX36 388 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ALPK3Q96L96 1907 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 GPR39O43194 453 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGEF15O94989 841 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1G2O95670 118 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 OGNP20774 298 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 FDXRP22570 491 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 CALB2P22676 271 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 KDSRQ06136 332 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 RINLQ6ZS11 566 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 PIANPQ8IYJ0 282 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC106Q9BWC9 280 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 MYOGP15173 224 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 EPCAMP16422 314 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 TFEBP19484 476 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 FMO4P31512 558 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 NTHL1P78549 312 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 TYSND1Q2T9J0 566 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 LSMEM2Q8N112 164 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 PAF1Q8N7H5 531 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 STX7O15400 261 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 MC4RP32245 332 aa23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 SNCBQ16143 134 aa23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 FAM91A1Q658Y4 838 aa23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms