RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 AURKCQ9UQB9 309 aa18.38■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MT66 165 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH2P05091 517 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRNA4P43681 627 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC12A2P55011 1212 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMD5Q16401 504 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CHPT1Q8WUD6 406 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CYGBQ8WWM9 190 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXL20Q96IG2 436 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 AP3B1O00203 1094 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CLIC3O95833 236 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN8P19075 237 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CD151P48509 253 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6AP1Q15904 470 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC6AQ6EIG7 209 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD8Q6ZWB6 473 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 OLFM1Q99784 485 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 NEURL2Q9BR09 285 aa18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM23O75077 832 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CPB1P15086 417 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 BMXP51813 675 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP1A4Q13733 1029 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SEPT6Q14141 434 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 TECRLQ5HYJ1 363 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 C17orf99Q6UX52 265 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf16Q9BUW7 83 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A087X1B8 175 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 DHRS12A0PJE2 317 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CLOCKO15516 846 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNG3O60359 315 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SNAP91O60641 907 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 PMPCBO75439 489 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 BAIAP3O94812 1187 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 F2P00734 622 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNE1P15382 129 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJB2P25686 324 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 POLD2P49005 469 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SEPT8Q92599 483 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD8Q96I13 439 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 AQP12BA6NM10 295 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SULT1C4O75897 302 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 IL10P22301 178 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CTGFP29279 349 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 HALP42357 657 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNC4Q03721 635 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 INPP5AQ14642 412 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 NIPAL1Q6NVV3 410 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CYHR1Q6ZMK1 362 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SPRED1Q7Z699 444 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNL1Q8IU54 200 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 AQP12AQ8IXF9 295 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ROPN1LQ96C74 230 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 PCED1BQ96HM7 432 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 LRCH3Q96II8 777 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 ZIC5Q96T25 663 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 SIK2Q9H0K1 926 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CD320Q9NPF0 282 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 HTTP42858 3142 aa18.35■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 J3QRK9 145 aa18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 NME4O00746 187 aa18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 TPST1O60507 370 aa18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 FASP25445 335 aa18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 TNK2Q07912 1038 aa18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM83EQ2M2I3 478 aa18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.34■□□□□ 0.53
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM35AQ86V20 835 aa18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms