RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414220.2

CHD1-202, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHD1, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1-202ENST00000414220 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 LRRC66Q68CR7 880 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 PNCKQ6P2M8 343 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 MACC1Q6ZN28 852 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 ZNF567Q8N184 647 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 DTD2Q96FN9 168 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 COQ10AQ96MF6 247 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 FCRL5Q96RD9 977 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 LYSMD1Q96S90 227 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 CARD9Q9H257 536 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 WDR26Q9H7D7 661 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 GPR27Q9NS67 375 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 SPASTQ9UBP0 616 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 CEP250Q9BV73 2442 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 TNFSF14O43557 240 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 PMPCBO75439 489 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 RASGRP1O95267 797 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 NDST3O95803 873 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 EPOP01588 193 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 CTSEP14091 401 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 ACTN2P35609 894 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 GEMP55040 296 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 FZD2Q14332 565 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 QPCTQ16769 361 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 AADACL2Q6P093 401 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 NLRP8Q86W28 1048 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 EID2Q8N6I1 236 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 AP2M1Q96CW1 435 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 WDR92Q96MX6 357 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1-202ENST00000414220 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 GIPC1O14908 333 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 SDC3O75056 442 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 PIAS2O75928 621 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 PRLP01236 227 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 TNFP01375 233 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ADRB1P08588 477 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 CDK4P11802 303 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 LHCGRP22888 699 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 DGKAP23743 735 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 TEAD1P28347 426 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ETV3P41162 512 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 GPR1P46091 355 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 KIAA1024LP59773 190 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 DPTQ07507 201 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 GALNT3Q14435 633 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ELOCQ15369 112 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 SHBQ15464 509 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 Q6ZVL8 140 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 GLRX5Q86SX6 157 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 GLMNQ92990 594 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 TBATAQ96M53 351 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 CDH19Q9H159 772 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 GBA3Q9H227 469 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 TRABDQ9H4I3 376 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 UBP1Q9NZI7 540 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 KLQ9UEF7 1012 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 OR1A2Q9Y585 309 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 TNFRSF10CO14798 259 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 CBFA2T3O75081 653 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 CLDN7O95471 211 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 HLA-DPA1P20036 260 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 TRIM23P36406 574 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1-202ENST00000414220 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms