RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 H0Y626 953 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 DCXO43602 365 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB14O43829 449 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 THRAP10827 490 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 PMLP29590 882 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 DEFB103AP81534 67 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.18■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 LPGAT1Q92604 370 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 LHX3Q9UBR4 397 aa20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.18■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 COX4I1P13073 169 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 CD1DP15813 335 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 ACTR3P61158 418 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 AP1S1P61966 158 aa20.17■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 TEX28O15482 410 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 FZD6O60353 706 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 CTSAP10619 480 aa20.17■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 GPR158Q5T848 1215 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 ALG14Q96F25 216 aa20.17■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 THTPAQ9BU02 230 aa20.17■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 KIAA0355O15063 1070 aa20.16■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 HDCP19113 662 aa20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 MAPK8P45983 427 aa20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 CSNK1DP48730 415 aa20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 TTPAP49638 278 aa20.16■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 ATP6V0D1P61421 351 aa20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 HTR3DQ70Z44 454 aa20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.16■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 DERL2Q9GZP9 239 aa20.16■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 LCHNA4D1U4 455 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 CDC25CP30307 473 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 SULT2A1Q06520 285 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 TRAF2Q12933 501 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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SUMO3-204ENST00000411651 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 MEAF6Q9HAF1 191 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 VPS28Q9UK41 221 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 PIRTP0C851 137 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 KCNA5P22460 613 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 PIK3R1P27986 724 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 EPHA3P29320 983 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-204ENST00000411651 CCR10P46092 362 aa20.15■□□□□ 0.82
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