RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 AKR1A1P14550 325 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 KCNC1P48547 511 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RPS6KA3P51812 740 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CDH13P55290 713 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 NFKB2Q00653 900 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 UNC50Q53HI1 259 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TRIML2Q8N7C3 387 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PSMG2Q969U7 264 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLCO4A1Q96BD0 722 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SUSD3Q96L08 255 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 UROC1Q96N76 676 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ASB2Q96Q27 587 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CIB1Q99828 191 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CCT7Q99832 543 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC39A3Q9BRY0 314 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MYLKQ15746 1914 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 BPTFQ12830 3046 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 AKAP10O43572 662 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MGEA5O60502 916 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 GLP2RO95838 553 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MMP2P08253 660 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC10A3P09131 477 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TYMPP19971 482 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ETFBP38117 255 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 GRIA3P42263 894 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 NME5P56597 212 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 FAM219BQ5XKK7 198 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MON1AQ86VX9 555 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TSPAN14Q8NG11 270 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 OR2T34Q8NGX1 318 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 OR2T3Q8NH03 318 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 FATE1Q969F0 183 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PTERQ96BW5 349 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 C3orf30Q96M34 536 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TRIM15Q9C019 465 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 AKTIPQ9H8T0 292 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MID1IP1Q9NPA3 183 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 KCTD3Q9Y597 815 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 A0A0J9YYE9 177 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ANGPT2O15123 496 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TIPRLO75663 272 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CNTN5O94779 1100 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ASLP04424 464 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CD1DP15813 335 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 GPX3P22352 226 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 THPOP40225 353 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CREB5Q02930 508 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TMEM259Q4ZIN3 620 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ALFQ53S48 1182 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MRNIPQ6NTE8 343 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DDIASQ8IXT1 998 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MYO1HQ8N1T3 1032 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TBATAQ96M53 351 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 IL1RL2Q9HB29 575 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 A0A0U1RQF3 1178 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 F8W810 466 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 FDXRP22570 491 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 USP46P62068 366 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MGAT3Q09327 533 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 EFEMP1Q12805 493 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CYHR1Q6ZMK1 362 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SERINC5Q86VE9 423 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CARM1Q86X55 608 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MIER2Q8N344 545 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TWIST2Q8WVJ9 160 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC39A13Q96H72 371 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ADAM2Q99965 735 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PNPLA3Q9NST1 481 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MYRFQ9Y2G1 1151 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms