RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 NFKB1P19838 968 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 DGKAP23743 735 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ETV3P41162 512 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTSQ03393 145 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDKN3Q16667 212 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 INAVAQ3KP66 663 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 DENND2CQ68D51 928 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 MACC1Q6ZN28 852 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 Q6ZVL8 140 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 NUS1Q96E22 293 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDC6Q99741 560 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 UCKL1Q9NWZ5 548 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 K7ESM1 405 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 C1SP09871 688 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 GIMD1P0DJR0 217 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PMLP29590 882 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM23P36406 574 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 STC1P52823 247 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 GALNT3Q14435 633 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 NFATC4Q14934 902 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PNCKQ6P2M8 343 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PID1Q7Z2X4 250 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 EID2Q8N6I1 236 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 FCRL5Q96RD9 977 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR1A2Q9Y585 309 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDK18Q07002 472 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCSK7Q16549 785 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 KDELC1Q6UW63 502 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP29Q9HBJ7 922 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBP1Q9NZI7 540 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PMPCBO75439 489 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLDN7O95471 211 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 JUNDP17535 347 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLCO6A1Q86UG4 719 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBFAQ8N0V3 343 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTC13Q8NBP0 860 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 H3BM21 787 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM38O00635 465 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNFSF14O43557 240 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 NDST3O95803 873 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 WNT3AP56704 352 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIAA1024LP59773 190 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 DPTQ07507 201 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPS6KA1Q15418 735 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALG11Q2TAA5 492 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCTD16Q68DU8 428 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDLIM2Q96JY6 352 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 LGR4Q9BXB1 951 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 ABCG8Q9H221 673 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNF1Q9H3M0 494 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 FTSJ1Q9UET6 329 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 WASF3Q9UPY6 502 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 F5H423 210 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCAMP1O15126 338 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNN4O15554 427 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 DKK1O94907 266 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 SOD1P00441 154 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSHRP16473 764 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 HTR1BP28222 390 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 TEAD1P28347 426 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPARDQ03181 441 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF765Q7L2R6 523 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 NLRP8Q86W28 1048 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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