RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 KATNAL1Q9BW62 490 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLITRK2Q9H156 845 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASB8Q9H765 288 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDE11AQ9HCR9 933 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFRSF19Q9NS68 423 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 UPB1Q9UBR1 384 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 IKZF3Q9UKT9 509 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 L1RE1Q9UN81 338 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 VSIG4Q9Y279 399 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBX22Q9Y458 520 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANO9A1A5B4 782 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 MGEA5O60502 916 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSHBP01222 138 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 MELTFP08582 738 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF23P17027 643 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ISL1P61371 349 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 NECTIN1Q15223 517 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC96Q2M329 555 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 C2orf83Q53S99 150 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALS2CLQ60I27 953 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q6ZSR9 355 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALNT7Q86SF2 657 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR52I2Q8NH67 350 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 C2CD4CQ8TF44 421 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNJ9Q92806 393 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHMP4CQ96CF2 233 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNGB3Q9NQW8 809 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 IP6K2Q9UHH9 426 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 UMODL1Q5DID0 1318 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR6C68A6NDL8 312 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 RSPH10B2B2RC85 870 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 RGS11O94810 467 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 RSPH10BP0C881 870 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CENPAP49450 140 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEFQ10587 303 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM35AQ53FP2 167 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTI2Q6NXR4 508 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 BEND5Q7L4P6 421 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCN4BQ8IWT1 228 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAGED4Q96JG8 741 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAL3ST4Q96RP7 486 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCRT1Q9BWW7 348 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 WFDC1Q9HC57 220 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIX2Q9NPC8 291 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUDT4Q9NZJ9 180 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 MUTYHQ9UIF7 546 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 C17orf51A8MQB3 221 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SYN3O14994 580 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPP40O75818 363 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 LARGE1O95461 756 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP4B1P13584 511 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 MTHFRP42898 656 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAX8Q06710 450 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDK18Q07002 472 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHHQ15465 462 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAPKAPK3Q16644 382 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT24Q2M2I5 525 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR7E24Q6IFN5 339 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF34Q8IZ26 560 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF152Q8N8N0 203 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 RND1Q92730 232 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNMB3Q9NPA1 279 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC22A11Q9NSA0 550 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDRG3Q9UGV2 375 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ITGB4P16144 1822 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPIPB13A6NJU9 1138 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACOD1A6NK06 481 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPM2AB3EWF7 344 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SRRM5B3KS81 715 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRM8O00222 908 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 SOCS3O14543 225 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms