RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 ASRGL1Q7L266 308 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 CAMK1DQ8IU85 385 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 OR6K2Q8NGY2 324 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 PNPOQ9NVS9 261 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 CFAP73A6NFT4 308 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 DLX3O60479 287 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 T-ENOLP0DO92 83 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 FAM83EQ2M2I3 478 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 PIH1D2Q8WWB5 315 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 SLC40A1Q9NP59 571 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 SAR1AQ9NR31 198 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 FKBPLQ9UIM3 349 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO4-201ENST00000371935 PER2O15055 1255 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 CCDC166P0CW27 439 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TARSP26639 723 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 PMLP29590 882 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 MAPK8P45983 427 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 EPHB1P54762 984 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 USP4Q13107 963 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 FUT11Q495W5 492 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TMEM207Q6UWW9 146 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ANKRD49Q8WVL7 239 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ZSWIM3Q96MP5 696 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TRIM33Q9UPN9 1127 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ZNF711Q9Y462 761 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 STX7O15400 261 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 PIGNO95427 931 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 HSPA4LO95757 839 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 IGSF6O95976 241 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 CA3P07451 260 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 POU2F2P09086 479 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 SRCP12931 536 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 SLC26A3P40879 764 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 PIM3Q86V86 326 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 KLHL29Q96CT2 875 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 MAGEE1Q9HCI5 957 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 FCHO1O14526 889 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 CBX6O95503 412 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 SUOXP51687 545 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 RPL26P61254 145 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 BCL2L1Q07817 233 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 FAM91A1Q658Y4 838 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 MAVSQ7Z434 540 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 LPGAT1Q92604 370 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 IRF7Q92985 503 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TCF12Q99081 682 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 EBF4Q9BQW3 602 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 DRC3Q9H069 523 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TNKS2Q9H2K2 1166 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 HAO1Q9UJM8 370 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 MYO7AQ13402 2215 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 H7C0S8 307 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TCF3P15923 654 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 CEBPBP17676 345 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 CTPS1P17812 591 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 MC4RP32245 332 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 STK19P49842 368 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 TTC7BQ86TV6 843 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 BBS2Q9BXC9 721 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 NMUR2Q9GZQ4 415 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 POPDC3Q9HBV1 291 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 BPIFA1Q9NP55 256 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 HS3ST2Q9Y278 367 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 SCN8AQ9UQD0 1980 aa25.18■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 A0A0U1RQS6 177 aa25.17■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ZNF195O14628 629 aa25.17■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 SOCS5O75159 536 aa25.17■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 RASSF9O75901 435 aa25.17■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
REXO4-201ENST00000371935 ALPIP09923 528 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms