RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 AP1S1P61966 158 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 IL5RAQ01344 420 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 ITFG1Q8TB96 612 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 APOL4Q9BPW4 351 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 FZD8Q9H461 694 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 A0A1B0GW55 424 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 DUX4L2P0CJ85 424 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 DUX4L3P0CJ86 424 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 DUX4L4P0CJ87 422 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 DUX4L5P0CJ88 424 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 DUX4L6P0CJ89 424 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 DUX4L7P0CJ90 424 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 MARCKSL1P49006 195 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 GNA12Q03113 381 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 CBX3Q13185 183 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 NEDD8Q15843 81 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 C17orf64Q86WR6 236 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 LEMD2Q8NC56 503 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 OR10G6Q8NH81 332 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 PLD4Q96BZ4 506 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 RNF145Q96MT1 663 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 DUX4Q9UBX2 424 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 INSL6Q9Y581 213 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 E9PAM4 449 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 PEX10O60683 326 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 MACC1Q6ZN28 852 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 PCED1BQ96HM7 432 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 TRMOQ9BU70 441 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 LINGO1Q96FE5 620 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 CPQQ9Y646 472 aa20.58■□□□□ 0.89
NCKAP1-201ENST00000360982 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 WNT7AO00755 349 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 MDM4O15151 490 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 HIST1H2ABP04908 130 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 HK2P52789 917 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.881e-7■□□□□ 10.3
NCKAP1-201ENST00000360982 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 CHSY3Q70JA7 882 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 AADATQ8N5Z0 425 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 RHOJQ9H4E5 214 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 TAF4O00268 1085 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 NTRK1P04629 796 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 USP4Q13107 963 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 CERS4Q9HA82 394 aa20.58■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 GRIN2DO15399 1336 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 ATG13O75143 517 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 VIPP01282 170 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 ANGPT1Q15389 498 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 PPP1R14AQ96A00 147 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 REEP1Q9H902 201 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 PIK3R1P27986 724 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 HNF4AP41235 474 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 CRATP43155 626 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 CAP1Q01518 475 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 CTBP1Q13363 440 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 HERVK_113Q902F9 699 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 PEX11AO75192 247 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF24P17028 368 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 CCNCP24863 283 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 TALDO1P37837 337 aa20.57■□□□□ 0.88
NCKAP1-201ENST00000360982 USP46P62068 366 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms