RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GTW7 788 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 PSMD11O00231 422 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 RAD51BO15315 384 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 CFIP05156 583 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 HOXD12P35452 270 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 DR1Q01658 176 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 PTSQ03393 145 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 SPEM2Q0P670 501 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 STAT4Q14765 748 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 RUBCNQ92622 972 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 PATE3B3GLJ2 98 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 GM2AP17900 193 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 ETV3P41162 512 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN2P57739 230 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC14Q15048 493 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 CDKN3Q16667 212 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 LAYNQ6UX15 382 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZVL8 140 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 LINC00523Q86TU6 105 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 DCLK2Q8N568 766 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 CEP76Q8TAP6 659 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 SLCO2A1Q92959 643 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 COQ10AQ96MF6 247 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 H0Y8X5 98 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 FPGTO14772 594 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 C1SP09871 688 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 PTGIRP43119 386 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 STC1P52823 247 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 CENPTQ96BT3 561 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 NUS1Q96E22 293 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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HOXD4-201ENST00000306324 CD84Q9UIB8 345 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD4-201ENST00000306324 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.34■■□□□ 1.17
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HOXD4-201ENST00000306324 CD38P28907 300 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PTK6Q13882 451 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TUBB2AQ13885 445 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 AGERQ15109 404 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 IRF4Q15306 451 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.33■■□□□ 1.16
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HOXD4-201ENST00000306324 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.33■■□□□ 1.16
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HOXD4-201ENST00000306324 DTD2Q96FN9 168 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TRABDQ9H4I3 376 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
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HOXD4-201ENST00000306324 TPH1P17752 444 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 IGFALSP35858 605 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ADCY8P40145 1251 aa22.32■■□□□ 1.16
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HOXD4-201ENST00000306324 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 JAMLQ86YT9 394 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TCEAL3Q969E4 200 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 EID2BQ96D98 161 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 POM121BA6NF01 834 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 CDH17Q12864 832 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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