RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 FLNCQ14315 2725 aa7.88□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN11A1L157 253 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PIPSLA2A3N6 862 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC14CA4D256 554 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MU76 341 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RASA4BC9J798 803 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RASA4O43374 803 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL41O60662 606 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA7AO75326 666 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CALCAP01258 141 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 DESP17661 470 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 MPSTP25325 297 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM23P36406 574 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ACVRL1P37023 503 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP12P39900 470 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTR1BP42025 376 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 GNPDA1P46926 289 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ARSDP51689 593 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTR1AP61163 376 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOX1Q15067 660 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PNCKQ6P2M8 343 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PASD1Q8IV76 773 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5C3BQ969T7 300 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PMEPA1Q969W9 287 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 C18orf8Q96DM3 657 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TBCBQ99426 244 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CTRCQ99895 268 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PDP2Q9P2J9 529 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.87□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 HEATR9A2RTY3 570 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 C21orf140B9A014 251 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CREG1O75629 220 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF202O95125 648 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 DLGAP3O95886 979 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CD160O95971 181 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ERBB2P04626 1255 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PYGLP06737 847 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NR1D1P20393 614 aa7.86□□□□□ -1.15
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PGGT1B-201ENST00000296642 EPHA4P54764 986 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE1BQ01064 536 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL2L1Q07817 233 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXM1Q08050 763 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA5AQ13591 1074 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP8Q14114 963 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 IL11RAQ14626 422 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ESPL1Q14674 2120 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNA6Q15825 494 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP15Q460N3 678 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM131BQ86XD5 332 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 BMPERQ8N8U9 685 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LMO3Q8TAP4 145 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NCSTNQ92542 709 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCE1Q969G3 411 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NUS1Q96E22 293 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRY4Q9C004 299 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CROTQ9UKG9 612 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PADI1Q9ULC6 663 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RELNP78509 3460 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP4O75096 1905 aa7.86□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.85□□□□□ -1.15
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