RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 PSME3P61289 254 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.832e-10■■■■■ 34
USP25-202ENST00000285681 TRMOQ9BU70 441 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CCNDBP1O95273 360 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ENPEPQ07075 957 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SH3GL3Q99963 347 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 C1orf50Q9BV19 199 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NFAT5O94916 1531 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FAM25AB3EWG3 89 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FAM25CB3EWG5 89 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FAM25GB3EWG6 89 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 H3BM21 787 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ATP6AP2O75787 350 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CDKN2BP42772 138 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 DAOAP59103 153 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 INAQ16352 499 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ARMCX4Q5H9R4 360 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RORBQ92753 470 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 COPG2Q9UBF2 871 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 VPS4AQ9UN37 437 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LINC00032P0C843 101 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CHSY3Q70JA7 882 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TFAP2BQ92481 460 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SCLYQ96I15 445 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 OR7D4Q8NG98 312 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PLD4Q96BZ4 506 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PANX1Q96RD7 426 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 GBA3Q9H227 469 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MYBL2P10244 700 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 IDSP22304 550 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ERVK-21P61565 698 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLC25A3Q00325 362 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 DSC2Q02487 901 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 STYXQ8WUJ0 223 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 EPHA3P29320 983 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CEP78Q5JTW2 689 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CCDC185Q8N715 623 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 C2P06681 752 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LMO2P25791 158 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RANBP1P43487 201 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 AP2M1Q96CW1 435 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PTGES3LE9PB15 166 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 GRIA3P42263 894 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 STX4Q12846 297 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TRABD2AQ86V40 505 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ABCG8Q9H221 673 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 STMN3Q9NZ72 180 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 GULP1Q9UBP9 304 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ACRP10323 421 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PBX3P40426 434 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 EML3Q32P44 896 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 AP2A1O95782 977 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 IDO1P14902 403 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 JAM2P57087 298 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms