RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 C5AR1P21730 350 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 HNF1BP35680 557 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 POU6F1Q14863 301 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 BBS9Q3SYG4 887 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PMS2CLQ68D20 193 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 FAM124AQ86V42 546 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC25Q86WR0 208 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PAF1Q8N7H5 531 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 HDAC8Q9BY41 377 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 FAM186AA6NE01 2351 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1W2PQ67 120 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 CAPN8A6NHC0 703 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF217O75362 1048 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PTGER3P43115 390 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC6Q16204 474 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 CDKN3Q16667 212 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC38Q502W7 563 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 AGBL4Q5VU57 503 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 SCRN2Q96FV2 425 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 GGT7Q9UJ14 662 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ITM2BQ9Y287 266 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1W2PP55 124 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ACADMP11310 421 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ADRB3P13945 408 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TGM1P22735 817 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 LHCGRP22888 699 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ACSL1P33121 698 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 NPY2RP49146 381 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PMS2P54278 862 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TTC7BQ86TV6 843 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 BFARQ9NZS9 450 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 A8MX80 341 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 AREL1O15033 823 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 MAP3K13O43283 966 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 IGLV3-19P01714 112 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ELK3P41970 407 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 NEK3P51956 506 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TAS2R38P59533 333 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 RALGDSQ12967 914 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 CENPUQ71F23 418 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 EID2BQ96D98 161 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 SPACA7Q96KW9 195 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 LYSMD1Q96S90 227 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 IL22Q9GZX6 179 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 RAB23Q9ULC3 237 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF711Q9Y462 761 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 KCTD3Q9Y597 815 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 AGPSO00116 658 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 AP3B1O00203 1094 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 LDB2O43679 373 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 DNTTP04053 509 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 CD6P30203 668 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 MMP12P39900 470 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF778Q96MU6 729 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 DYRK4Q9NR20 520 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 ARL5AQ9Y689 179 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 NFS1Q9Y697 457 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53B-201ENST00000280780 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms