RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.49■□□□□ 0.55
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HOXC11-201ENST00000243082 SLC4A1P02730 911 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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HOXC11-201ENST00000243082 LPOP22079 712 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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HOXC11-201ENST00000243082 TCF12Q99081 682 aa18.47■□□□□ 0.55
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HOXC11-201ENST00000243082 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 FKBPLQ9UIM3 349 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 MED16Q9Y2X0 877 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 ZBTB14O43829 449 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 CD1DP15813 335 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 AP1S1P61966 158 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC11-201ENST00000243082 METTL21CQ5VZV1 264 aa18.46■□□□□ 0.55
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