RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 DNAJB13P59910 316 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 RAB10P61026 200 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 DMWDQ09019 674 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 BST1Q10588 318 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 BMPR2Q13873 1038 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 USP10Q14694 798 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 POU6F1Q14863 301 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 SIRPB2Q5JXA9 342 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 FAM47EQ6ZV65 393 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 MFN1Q8IWA4 741 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 PLPP6Q8IY26 295 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 UNC5BQ8IZJ1 945 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 DTWD2Q8NBA8 298 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 CFAP61Q8NHU2 1237 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 FIBINQ8TAL6 211 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 WBP2Q969T9 261 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 GCNAQ96QF7 691 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 TRIB3Q96RU7 358 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 AGAP2Q99490 1192 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 SLC46A2Q9BY10 475 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 WWP1Q9H0M0 922 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 KCNK13Q9HB14 408 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 OXSMQ9NWU1 459 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM216Q9P0N5 145 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 WNT16Q9UBV4 365 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 FBXL21Q9UKT6 434 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 PSAT1Q9Y617 370 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 COMMD10Q9Y6G5 202 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 CAPN7Q9Y6W3 813 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 R4GN57 208 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 MYOFQ9NZM1 2061 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 EML5Q05BV3 1969 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 HELZP42694 1942 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF292O60281 2723 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 WDR91A4D1P6 747 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 H0Y626 953 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 H7C0S8 307 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 LDB2O43679 373 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 GREM1O60565 184 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 XYLBO75191 536 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 RASSF9O75901 435 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 KCNA4P22459 653 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 WEE1P30291 646 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ACVRL1P37023 503 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 SLC1A6P48664 564 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 MNAT1P51948 309 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 STARD6P59095 220 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 PRAMEP78395 509 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 MESP2Q0VG99 397 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 GRM3Q14832 879 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ACAP2Q15057 778 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ANGPT1Q15389 498 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 CYTH1Q15438 398 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 CHI3L2Q15782 390 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 FAM83EQ2M2I3 478 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 AGAP9Q5VTM2 703 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 MBLAC2Q68D91 279 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 FAM45BPQ6NSW5 357 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 CES3Q6UWW8 571 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ASRGL1Q7L266 308 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 SFTPA1Q8IWL2 248 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 PGBD5Q8N414 524 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 PJA1Q8NG27 643 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 FAM45AQ8TCE6 357 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 MAGEC3Q8TD91 643 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 OTUB2Q96DC9 234 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF778Q96MU6 729 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 APOL2Q9BQE5 337 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 SYTL2Q9HCH5 934 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 GKN1Q9NS71 199 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA3-201ENST00000229265 HAO1Q9UJM8 370 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms