RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 CD320Q9NPF0 282 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 BCL10O95999 233 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 JCHAINP01591 159 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CYP2C9P11712 490 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 AXLP30530 894 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 APLP1P51693 650 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 USP51Q70EK9 711 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 BNIPLQ7Z465 357 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ROPN1LQ96C74 230 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 C12orf42Q96LP6 360 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 OLFM1Q99784 485 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SNX25Q9H3E2 840 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RAD54BQ9Y620 910 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NOL3O60936 208 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GFAPP14136 432 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NCK1P16333 377 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ZNF24P17028 368 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RABGGTBP53611 331 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 FAM187BQ17R55 369 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ITPKCQ96DU7 683 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 FAR2Q96K12 515 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TSC2P49815 1807 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 H0Y858 1186 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 DAB1O75553 588 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CLPXO76031 633 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CYP51A1Q16850 503 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 KIF19Q2TAC6 998 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 XAF1Q6GPH4 301 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SNX29P2Q8IUI4 249 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NT5C3BQ969T7 300 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TLR9Q9NR96 1032 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 V9GYQ6 96 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 INPP4BO15327 924 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 BEST1O76090 585 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NR4A1P22736 598 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SLC6A2P23975 617 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SHMT2P34897 504 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 OPRL1P41146 370 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TPI1P60174 286 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 BFSP2Q13515 415 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TRPV3Q8NET8 790 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 LHPPQ9H008 270 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 E2F6O75461 281 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SEC14L2O76054 403 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 HSD17B1P14061 328 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 BDNFP23560 247 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 DNAJB1P25685 340 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RFC2P35250 354 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 IFNEQ86WN2 208 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 C19orf60Q96EN9 201 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TEKT5Q96M29 485 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SPATA33Q96N06 139 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ESRRBO95718 433 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TMBIM6P55061 237 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SEMA3BQ13214 749 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 UGP2Q16851 508 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TRIM16LQ309B1 348 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ZNF773Q6PK81 442 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NAT16Q8N8M0 369 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.9 ms