RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 TBX18O95935 607 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 VIPP01282 170 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 PROZP22891 400 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 LIG4P49917 911 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 GTF2BQ00403 316 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 SATB1Q01826 763 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF844Q08AG5 666 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MYO1EQ12965 1108 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 GPS1Q13098 491 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 SLC12A1Q13621 1099 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 HTR4Q13639 388 aa8.05□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 DCLK2Q8N568 766 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CNNM3Q8NE01 707 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 POC1BQ8TC44 478 aa8.05□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TCHPQ9BT92 498 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.05□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ATRXP46100 2492 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ANHXE9PGG2 379 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 F8W810 466 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 J3KTA2 159 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 TEX28O15482 410 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 DHHO43323 396 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 RGS10O43665 173 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 TOM1L1O75674 476 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 ZNF202O95125 648 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 GLULP15104 373 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 TNFSF9P41273 254 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 GLUD2P49448 558 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 VAMP2P63027 116 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 METRNLQ641Q3 311 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM124AQ86V42 546 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TWNKQ96RR1 684 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 NEU1Q99519 415 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM5Q9C035 493 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.04□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CLDN3O15551 220 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 LAMTOR5O43504 91 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TIMM44O43615 452 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 FAM189A1O60320 539 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 C1RP00736 705 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 PIGRP01833 764 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 KRT1P04264 644 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CXCL8P10145 99 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 LAMP2P13473 410 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEA9P43362 315 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 STARD6P59095 220 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGAP8P85298 464 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 PNOCQ13519 176 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 GRM7Q14831 915 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.03□□□□□ -1.12
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