RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 BIKQ13323 160 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 P2RY11Q96G91 374 aa21.39■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.39■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 OR4A15Q8NGL6 344 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.37■■□□□ 1.01
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