RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	MROH6	A6NGR9	719 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ITM2A	O43736	263 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CLDN11	O75508	207 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ATP5H	O75947	161 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CBX6	O95503	412 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SERPINE1	P05121	402 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CPA3	P15088	417 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SERPINB3	P29508	390 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	GDI1	P31150	447 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PGGT1B	P53609	377 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	USP4	Q13107	963 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ADGRF1	Q5T601	910 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	NEPRO	Q6NW34	567 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	MTSS1L	Q765P7	747 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CHST9	Q7L1S5	443 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	FEM1C	Q96JP0	617 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	MGME1	Q9BQP7	344 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	EBF3	Q9H4W6	596 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	COL4A2	P08572	1712 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279		G3V2L1	256 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	KDELR3	O43731	214 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	GREM1	O60565	184 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ECI2	O75521	394 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ARSA	P15289	507 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PSMC3	P17980	439 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	GLDC	P23378	1020 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ARRB2	P32121	409 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CD151	P48509	253 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SLC1A6	P48664	564 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	POLD2	P49005	469 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	OXCT1	P55809	520 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	IL31	Q6EBC2	164 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	BHMT	Q93088	406 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SORT1	Q99523	831 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SPON2	Q9BUD6	331 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	KLC4	Q9NSK0	619 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1B0GVM2	712 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ILVBL	A1L0T0	632 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	AURKA	O14965	403 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	LDB2	O43679	373 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TSPAN3	O60637	253 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	RHOC	P08134	193 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	KIT	P10721	976 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	RALB	P11234	206 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SAT1	P21673	171 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	GRK2	P25098	689 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SOX9	P48436	509 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ITGA9	Q13797	1035 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	RAPH1	Q70E73	1250 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CEP97	Q8IW35	865 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM237	Q96Q45	408 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SAR1A	Q9NR31	198 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SEPT3	Q9UH03	358 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TLK1	Q9UKI8	766 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78

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