RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 H3BQF6 201 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PSMD11O00231 422 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 DNM1LO00429 736 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 VILLO15195 856 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CUTAO60888 179 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MTX2O75431 263 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TADA2AO75478 443 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 RHBDL1O75783 438 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 UBXN7O94888 489 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CRYZL1O95825 349 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 KRT6AP02538 564 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 KRT6BP04259 564 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TUBBP07437 444 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 RPS17P08708 135 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 GSTA2P09210 222 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ARP10275 920 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 UMPSP11172 480 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PDHA2P29803 388 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 IFNA8P32881 189 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CTNNB1P35222 781 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CDKN1BP46527 198 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 GABRB2P47870 512 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SLC9A3P48764 834 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 POLE2P56282 527 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 IL2P60568 153 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 GNG11P61952 73 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PSMC6P62333 389 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PRAMEP78395 509 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 FAM189BP81408 668 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 XIAPP98170 497 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TAP1Q03518 808 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 UBE3AQ05086 875 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CBFBQ13951 182 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SEC23AQ15436 765 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 RESP18Q5W5W9 173 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 USP49Q70CQ1 688 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ANO5Q75V66 913 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 VASH2Q86V25 355 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PALB2Q86YC2 1186 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MIB1Q86YT6 1006 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 DENND1CQ8IV53 801 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 DDIASQ8IXT1 998 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 NXPE1Q8N323 547 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CEP112Q8N8E3 955 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TC2NQ8N9U0 490 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 C11orf65Q8NCR3 313 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 GPR156Q8NFN8 814 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 OR1E3Q8WZA6 343 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TNFRSF14Q92956 283 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MR1Q95460 341 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 C18orf8Q96DM3 657 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 IQCDQ96DY2 449 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 C14orf79Q96F83 325 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 KCNK16Q96T55 309 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 WDR18Q9BV38 432 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 KLC2Q9H0B6 622 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 THAP2Q9H0W7 228 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CUEDC2Q9H467 287 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SLC39A2Q9NP94 309 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CENPMQ9NSP4 180 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TAB2Q9NYJ8 693 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MYO1AQ9UBC5 1043 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 NID2Q14112 1375 aa5.55□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 STK36Q9NRP7 1315 aa5.54□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.54□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa5.54□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PN81 502 aa5.54□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.54□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SLC15A5A6NIM6 579 aa5.54□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 B8ZZF3 427 aa5.54□□□□□ -1.52
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