RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PLLP	Q9Y342	182 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF711	Q9Y462	761 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	AURKA	O14965	403 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	BNIP3L	O60238	219 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	FAM107A	O95990	144 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GABRB3	P28472	473 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GK	P32189	559 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SEC24C	P53992	1094 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TMPRSS15	P98073	1019 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	RUNX3	Q13761	415 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	INSC	Q1MX18	579 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GAB4	Q2WGN9	574 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PKP3	Q9Y446	797 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736		A0A1W2PPC1	479 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ECI2	O75521	394 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	HMGCL	P35914	325 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CLCN5	P51795	746 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	KDM1B	Q8NB78	822 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	FRS2	Q8WU20	508 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	VPS11	Q9H270	941 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CAPN8	A6NHC0	703 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736		H7C0S8	307 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CCL22	O00626	93 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	NDUFAB1	O14561	156 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GSTA1	P08263	222 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ETV4	P43268	484 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ABCG1	P45844	678 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PTPRCAP	Q14761	206 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	COL19A1	Q14993	1142 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PDK4	Q16654	411 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PTPRN	Q16849	979 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	MTSS1L	Q765P7	747 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	LCA5	Q86VQ0	697 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	LYSMD1	Q96S90	227 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TLK1	Q9UKI8	766 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736		A0A096LPK6	155 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PFDN6	O15212	129 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	HAUS5	O94927	633 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SLC4A1	P02730	911 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ALPI	P09923	528 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CTPS1	P17812	591 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	POU4F1	Q01851	419 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GRM2	Q14416	872 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	USP45	Q70EL2	814 aa		18.22	■□□□□ 0.51

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