RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	UCMA	Q8WVF2	138 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	HVCN1	Q96D96	273 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	MTBP	Q96DY7	904 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	OR1F2P	Q96R84	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	AASS	Q9UDR5	926 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CLGN	O14967	610 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ANP32C	O43423	234 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SOCS5	O75159	536 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	NDUFB4	O95168	129 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CLDN14	O95500	239 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	TFPI	P10646	304 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	GPT	P24298	496 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	GLIPR1	P48060	266 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PRKG2	Q13237	762 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	BBS12	Q6ZW61	710 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SERINC2	Q96SA4	455 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A1W2PPH5	198 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	hDV102S1	A0JD36	115 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PRR23A	A6NEV1	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	KLRF2	D3W0D1	207 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007		K7ENM7	598 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	KDM4B	O94953	1096 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	WEE2	P0C1S8	567 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SRC	P12931	536 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	RRM1	P23921	792 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	VAMP2	P63027	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	TNFAIP1	Q13829	316 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ANKRD1	Q15327	319 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	EFNB3	Q15768	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CCDC6	Q16204	474 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	AMZ1	Q400G9	498 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ESCO2	Q56NI9	601 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	TSPYL6	Q8N831	410 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	UHRF2	Q96PU4	802 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CD180	Q99467	661 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	MMP28	Q9H239	520 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PREB	Q9HCU5	417 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	SIX4	Q9UIU6	781 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A087X0M5	115 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A1B0GX30	115 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	HSPB2	A8KAH6	182 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PER2	O15055	1255 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CEP104	O60308	925 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	TSPAN3	O60637	253 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	LMX1B	O60663	402 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	RFPL2	O75678	378 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	RGS11	O94810	467 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	PCNA	P12004	261 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TIMM9-208	ENST00000556007	CD58	P19256	250 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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