RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552268.5

APAF1-211, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 1,143 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1-211ENST00000552268 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 J3KR12 359 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 DAPK3O43293 454 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MFSD11O43934 449 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MAFKO60675 156 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 CST8O60676 142 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 PRAMEF11O60813 436 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 RAMP2O60895 175 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 APODP05090 189 aa6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 PRLRP16471 622 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 AOC1P19801 751 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 IL12RB1P42701 662 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 NUMBP49757 651 aa6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 GNG11P61952 73 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 CYTH1Q15438 398 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 PARP15Q460N3 678 aa6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 C2orf27AQ580R0 203 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 NPNTQ6UXI9 565 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 KDM1BQ8NB78 822 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 COG1Q8WTW3 980 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 FRS2Q8WU20 508 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 PTPRN2Q92932 1015 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 FATE1Q969F0 183 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 HMCESQ96FZ2 354 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 TSGA13Q96PP4 275 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 GABRG3Q99928 467 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 CARD9Q9H257 536 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MTG2Q9H4K7 406 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 DTLQ9NZJ0 730 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MYO10Q9HD67 2058 aa6.69□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 TTC34A8MYJ7 566 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 SGK1O00141 431 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 HRKO00198 91 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 RNF103O00237 685 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 KIF5CO60282 957 aa6.68□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 IL10RBQ08334 325 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 SLC20A2Q08357 652 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MTAPQ13126 283 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 ZNF234Q14588 700 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 IHHQ14623 411 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.68□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 LINGO4Q6UY18 593 aa6.68□□□□□ -1.34
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