RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 NEK11Q8NG66 645 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CCL4L1Q8NHW4 92 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 AGPAT1Q99943 283 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TRIM4Q9C037 500 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 FOXJ2Q9P0K8 574 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TNFRSF10CO14798 259 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TEX33O43247 280 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 DAPK3O43293 454 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 HTR7P34969 479 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ACOX1Q15067 660 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 AMZ1Q400G9 498 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 MAP9Q49MG5 647 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 SLITRK4Q8IW52 837 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 LGR4Q9BXB1 951 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 SEMA6CQ9H3T2 930 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 WDR26Q9H7D7 661 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 SP110Q9HB58 689 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 AP4E1Q9UPM8 1137 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 SIK3Q9Y2K2 1263 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CYSRT1A8MQ03 144 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 C9orf172C9J069 976 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 DFFAO00273 331 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 FAM87AP0C7U9 286 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TRIM23P36406 574 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CSRP3P50461 194 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 SCNN1BP51168 640 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 NFKB2Q00653 900 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 B4GALNT1Q00973 533 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TMEM164Q5U3C3 297 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CDKAL1Q5VV42 579 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 AFMIDQ63HM1 303 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PNCKQ6P2M8 343 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 DPPA4Q7L190 304 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PIM3Q86V86 326 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 KIAA1524Q8TCG1 905 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ECHDC3Q96DC8 303 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 RDH14Q9HBH5 336 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 STARD5Q9NSY2 213 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 IL17BQ9UHF5 180 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PQC6 194 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PRSS38A1L453 326 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 RHPN2P1A8MT19 583 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 B4GAT1O43505 415 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 SFTPCP11686 197 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 GM2AP17900 193 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CD82P27701 267 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ALDH4A1P30038 563 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 MAZP56270 477 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 OR1D5P58170 312 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CYP4F2P78329 520 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 OGDHQ02218 1023 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 C16orf72Q14CZ0 275 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TBR1Q16650 682 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CA9Q16790 459 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ACAD10Q6JQN1 1059 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 DTX1Q86Y01 620 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 MCOLN2Q8IZK6 566 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PELI3Q8N2H9 469 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 FANCLQ9NW38 375 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PCSK1NQ9UHG2 260 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CPNE6O95741 557 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 CCNB1P14635 433 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ERCC2P18074 760 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ITGB6P18564 788 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 WT1P19544 449 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PSMA2P25787 234 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 COPB1P53618 953 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 BIRC2Q13490 618 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ERMARDQ5T6L9 678 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 DENND2CQ68D51 928 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ATG14Q6ZNE5 492 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 GPBAR1Q8TDU6 330 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 NUS1Q96E22 293 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 B4GALT6Q9UBX8 382 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-214ENST00000548849 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-214ENST00000548849 ZW10O43264 779 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms