RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 PGBD3Q8N328 593 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PWWP2AQ96N64 755 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SMIM14Q96QK8 99 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 NAT9Q9BTE0 207 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF711Q9Y462 761 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 HEATR9A2RTY3 570 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MROH6A6NGR9 719 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CRTAMO95727 393 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PIRTP0C851 137 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LHCGRP22888 699 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMA3P25788 255 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MGAT1P26572 445 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 OXTRP30559 389 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGCLP35914 325 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 RALGDSQ12967 914 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 POU6F1Q14863 301 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 NEK5Q6P3R8 708 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 GANCQ8TET4 914 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 KIFC1Q9BW19 673 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SGK2Q9HBY8 427 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMD11O00231 422 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LAMTOR5O43504 91 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LDB2O43679 373 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKCGP05129 697 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TDGF1P13385 188 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ADPRHP54922 357 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPRRQ15256 657 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ELF2Q15723 593 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CCNJLQ8IV13 435 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PREBQ9HCU5 417 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf81A6NN90 581 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 C10orf142B7Z368 130 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MYBL2P10244 700 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 AVPR2P30518 371 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MTM1Q13496 603 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 BBS9Q3SYG4 887 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC66Q68CR7 880 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 BTBD1Q9H0C5 482 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SYBUQ9NX95 663 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 AURKAO14965 403 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC34A2O95436 690 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 STC1P52823 247 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CRADDP78560 199 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CREB5Q02930 508 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PTSQ03393 145 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGEF7Q14155 803 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CNGA3Q16281 694 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LIPIQ6XZB0 460 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM135Q86UB9 458 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MPP5Q8N3R9 675 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 EID2BQ96D98 161 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CD93Q9NPY3 652 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SOX13Q9UN79 622 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ITM2BQ9Y287 266 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 NUMA1Q14980 2115 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 NEMP1O14524 444 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 AXIN1O15169 862 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR37L1O60883 481 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CLDN7O95471 211 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC38Q502W7 563 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 STYXQ8WUJ0 223 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 IL17CQ9P0M4 197 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 GGT7Q9UJ14 662 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ARL5AQ9Y689 179 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms