RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	TADA2A	O75478	443 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NKX2-2	O95096	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ADA	P00813	363 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FYN	P06241	537 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NPS	P0C0P6	89 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IRF1	P10914	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ERCC2	P18074	760 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DRD4	P21917	467 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KEL	P23276	732 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC37A1	P57057	533 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	EVC	P57679	992 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	RCN2	Q14257	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF21B	O75037	1637 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PRG0	241 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	QSOX1	O00391	747 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DSCR3	O14972	297 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HMMR	O75330	724 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A12	O75746	678 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	STAM2	O75886	525 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TPO	P07202	933 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CBSL	P0DN79	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	P4HA1	P13674	534 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFB7	P17568	137 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	EDN2	P20800	178 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PON1	P27169	355 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TYK2	P29597	1187 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CBS	P35520	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CD86	P42081	329 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AGTR2	P50052	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CCT8	P50990	548 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HSD17B7	P56937	341 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBA4A	P68366	448 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DPP10	Q8N608	796 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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