RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 DSELQ8IZU8 1212 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 HTRA1Q92743 480 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ASIC4Q96FT7 647 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CPXM1Q96SM3 734 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CHST12Q9NRB3 414 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 COPG2Q9UBF2 871 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 GINS2Q9Y248 185 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PDHXO00330 501 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SOCS2O14508 198 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 DCXO43602 365 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LIASO43766 372 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB14O43829 449 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 UGT2B11O75310 529 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 EPN2O95208 641 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ETS1P14921 441 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 FGFR3P22607 806 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CD40LGP29965 261 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 NUDT2P50583 147 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ARSEP51690 589 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 DYNLT1P63172 113 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 GPS1Q13098 491 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 KLF10Q13118 480 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MSS51Q4VC12 460 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 AGAP6Q5VW22 663 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 XAF1Q6GPH4 301 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 IFNL1Q8IU54 200 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ANKFN1Q8N957 763 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 KYQ8NBH2 561 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 AGAP4Q96P64 663 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SYT17Q9BSW7 474 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 BCO2Q9BYV7 579 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 H3BRB1 525 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MED7O43513 233 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 GSNP06396 782 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 BMP1P13497 986 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 NUMBP49757 651 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CCNA1P78396 465 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TAP1Q03518 808 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SLC12A1Q13621 1099 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SCML4Q8N228 414 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 OR2T3Q8NH03 318 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PPTC7Q8NI37 304 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ADI1Q9BV57 179 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CEP350Q5VT06 3117 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 A0A0B4J203 849 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 M0QYV0 167 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MEN1O00255 615 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PIK3R2O00459 728 aa8.49□□□□□ -1.05
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TRPS1-209ENST00000519674 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 HTR2BP41595 481 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 DPP6P42658 865 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CDKN2BP42772 138 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 POLD2P49005 469 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ETV1P50549 477 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 NDST1P52848 882 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 RHAGQ02094 409 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TNFAIP2Q03169 654 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MERTKQ12866 999 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 BNIP2Q12982 314 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MAPK11Q15759 364 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ESCO2Q56NI9 601 aa8.49□□□□□ -1.05
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