RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MCM8Q9UJA3 840 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTHP01270 115 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NUDT17P0C025 328 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM17Q86X19 198 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAP2K6P52564 334 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 METTL21CQ5VZV1 264 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CASP12Q6UXS9 341 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHSY3Q70JA7 882 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OFCC1Q8IZS5 231 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FICDQ9BVA6 458 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABCG4Q9H172 646 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PHYHO14832 338 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYL12AP19105 171 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCT3P49368 545 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP1A2P50993 1020 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IL2P60568 153 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CUL2Q13617 745 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AP1ARQ63HQ0 302 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHSY1Q86X52 802 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 THAP1Q9NVV9 213 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DPP3Q9NY33 737 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 INSL6Q9Y581 213 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MGAMO43451 1857 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EFCAB7A8K855 629 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FTCDNL1E5RQL4 147 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HAUS5O94927 633 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CELF2O95319 508 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RARGP13631 454 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BCL2L1Q07817 233 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RASA2Q15283 850 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DDR2Q16832 855 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NEPROQ6NW34 567 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRP5LA4QPB2 252 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NSG1P42857 185 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DLG2Q15700 870 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WNT8BQ93098 351 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC25A23Q9BV35 468 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAGEH1Q9H213 219 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR5K3A6NET4 321 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP11B1P15538 503 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SP4Q02446 784 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACCSLQ4AC99 568 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DDI2Q5TDH0 399 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LIN54Q6MZP7 749 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FIBCD1Q8N539 461 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IL31RAQ8NI17 732 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MMACHCQ9Y4U1 282 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C9J4A7 227 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD82P27701 267 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BMI1P35226 326 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABATP80404 500 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTMR2Q13614 643 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RSU1Q15404 277 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 REP15Q6BDI9 236 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 XKRXQ6PP77 449 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYGBQ8WWM9 190 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms