RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	VPS18	Q9P253	973 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ABCC6	O95255	1503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CPS1	P31327	1500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		H0YIV9	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		H3BQF6	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PSMD14	O00487	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TRIAP1	O43715	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SLC25A17	O43808	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SERPINC1	P01008	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	IFNB1	P01574	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	KRT5	P13647	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	JUP	P14923	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PPP3CB	P16298	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	GATA3	P23771	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	GCH1	P30793	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CPA2	P48052	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SEC24C	P53992	1094 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SCN1B	Q07699	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	GALNT2	Q10471	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SEC23B	Q15437	767 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	AACS	Q86V21	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		Q8N1X5	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC51	Q96ER9	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TECPR2	O15040	1411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms