RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COG7P83436 770 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMG2Q02383 582 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSHL1Q14406 222 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF12Q16514 161 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF683Q8IZ20 524 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCNAQ96QF7 691 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYN3O14994 580 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLG1Q12959 904 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LSAMPQ13449 338 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIM3Q86V86 326 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR6Y1Q8NGX8 325 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GATA6Q92908 595 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR9Q9NR96 1032 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SBK3P0C264 359 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPY2RP49146 381 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL14P50914 215 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA24Q86W54 205 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHF21BQ96EK2 531 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FCRL5Q96RD9 977 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPAS2Q99743 824 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIKE1Q9BRV8 207 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACOT9Q9Y305 439 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIOO75962 3097 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPN8A6NHC0 703 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBX4O00257 560 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COCHO43405 550 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLX3O60479 287 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKBP6O75344 327 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMP2P08253 660 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TACR2P21452 398 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC12A2P55011 1212 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIN52Q52LA3 116 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH2D4BQ5SQS7 431 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTRT2Q8TDY3 377 aa15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC160A6NGH7 325 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDAC3O15379 428 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDCP19113 662 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R39P59534 338 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK18Q07002 472 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIPMQ5VYY2 423 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC14AQ86T13 490 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDAC10Q969S8 669 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDP2Q9P2J9 529 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SQORQ9Y6N5 450 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INPPL1O15357 1258 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTSS1O43312 755 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNAP91O60641 907 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STMN1P16949 149 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THOP1P52888 689 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMEL1Q495T6 779 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAYNQ6UX15 382 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBATAQ96M53 351 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM192AQ9GZU8 254 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHOJQ9H4E5 214 aa15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0J9YVX5 310 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A8MX80 341 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASLP04424 464 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSF2RAP15509 400 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADRA1AP35348 466 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCID2Q5JVF3 399 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXNDC8Q6A555 127 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RANBP10Q6VN20 620 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACAD11Q709F0 780 aa15.55■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSELQ8IZU8 1212 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms