RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SRL	Q86TD4	932 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PQLC3	Q8N755	202 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	HDAC11	Q96DB2	347 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MGME1	Q9BQP7	344 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SATB2	Q9UPW6	733 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM38	O00635	465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TOR1B	O14657	336 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	WNT9A	O14904	365 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MATN3	O15232	486 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SPOP	O43791	374 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MFSD11	O43934	449 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	UGT2B4	P06133	528 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	COMT	P21964	271 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPN7	P35236	360 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CDKN2B	P42772	138 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NR2C2	P49116	596 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	DNA2	P51530	1060 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ELP6	Q0PNE2	266 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC14A2	Q15849	920 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ISX	Q2M1V0	245 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF284	Q2VY69	593 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MARC1	Q5VT66	337 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PLD5	Q8N7P1	536 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	EXD1	Q8NHP7	514 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR48	Q8TAF3	677 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	IFT43	Q96FT9	208 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	FEM1C	Q96JP0	617 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	APOLD1	Q96LR9	279 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	OLFM3	Q96PB7	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR27	Q9NS67	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	DTL	Q9NZJ0	730 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1W2PQU0	124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC66	A2RUB6	948 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SPINT1	O43278	529 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NFKBIA	P25963	317 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ABL2	P42684	1182 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP13	P45452	471 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RGR	P47804	291 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF5A	Q12840	1032 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TFDP2	Q14188	446 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF235	Q14590	738 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP2R5E	Q16537	467 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	UGP2	Q16851	508 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	USP53	Q70EK8	1073 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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