RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 CTSEP14091 401 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 CCNCP24863 283 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 NFKBIAP25963 317 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 VIPR1P32241 457 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1024LP59773 190 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 MESDQ14696 234 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ACOX1Q15067 660 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 GUSBP11Q6P575 273 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 RD3Q7Z3Z2 195 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC35F3Q8IY50 421 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PQLC3Q8N755 202 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 MAPK15Q8TD08 544 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 FATE1Q969F0 183 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 SCRN2Q96FV2 425 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 KLQ9UEF7 1012 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PPIL1Q9Y3C6 166 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 DGKBQ9Y6T7 804 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 APC2O95996 2303 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 CHD6Q8TD26 2715 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ACACAQ13085 2346 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 TNFP01375 233 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ALPIP09923 528 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 KDELR1P24390 212 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 RPIAP49247 311 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 CNGA3Q16281 694 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PNCKQ6P2M8 343 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 C19orf48Q6RUI8 117 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PIH1D2Q8WWB5 315 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 RAPGEF5Q92565 580 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 SEMA3CQ99985 751 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 LHX6Q9UPM6 363 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM202A6NGA9 273 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP3K6O95382 1288 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 TGM2P21980 687 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 CES1P23141 567 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP25P42331 645 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ITKQ08881 620 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 KCTD16Q68DU8 428 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PELI3Q8N2H9 469 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 DEPDC7Q96QD5 511 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 AMACRQ9UHK6 382 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PADI4Q9UM07 663 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 DOLKQ9UPQ8 538 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 RAI2Q9Y5P3 530 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 TNFRSF10CO14798 259 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 FZD6O60353 706 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 MTA2O94776 668 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PDHA1P08559 390 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 KELP23276 732 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 GBE1Q04446 702 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PERM1Q5SV97 790 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ALG1LQ6GMV1 187 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 GKN2Q86XP6 184 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PDXPQ96GD0 296 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 RNF157Q96PX1 679 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 LGR4Q9BXB1 951 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 ASXL3Q9C0F0 2248 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 A0A087WV48 116 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PSMD11O00231 422 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 MX2P20592 715 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 LHCGRP22888 699 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 IHHQ14623 411 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPRRQ15256 657 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 CNGA4Q8IV77 575 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRN4Q8WUT4 740 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 NAT6Q93015 286 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 NUS1Q96E22 293 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CB-208ENST00000455580 WDR26Q9H7D7 661 aa24.03■■□□□ 1.44
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