RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 IL1R2P27930 398 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 HCAR3P49019 387 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 RENBPP51606 427 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 KIAA1024LP59773 190 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SKOR1P84550 965 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL30Q0D2K2 578 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 LBRQ14739 615 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SMTNL2Q2TAL5 461 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 FILIP1LQ4L180 1135 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SFTPA2Q8IWL1 248 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PELI3Q8N2H9 469 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF843Q8N446 348 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM46DQ8NEK8 389 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 OR56A4Q8NGH8 313 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.751e-7■■■□□ 16.1
SH3BP4-206ENST00000446904 LGR4Q9BXB1 951 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM168Q9H0V1 697 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR26Q9H7D7 661 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ZWILCHQ9H900 591 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 EPB41L5Q9HCM4 733 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP4F12Q9HCS2 524 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR70Q9NW82 654 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 B4GALT6Q9UBX8 382 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 MOSPD1Q9UJG1 213 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SCINQ9Y6U3 715 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 UNC13CQ8NB66 2214 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PQM1 296 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SMTNL1A8MU46 457 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 B4DGG1 531 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 H3BRJ5 948 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 AGRPO00253 132 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PLD2O14939 933 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MYBL1P10243 752 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HGFP14210 728 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 KELP23276 732 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 UGT1A5P35504 534 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PCK1P35558 622 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKCIP41743 596 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 RHDQ02161 417 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CFHR1Q03591 330 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 VAC14Q08AM6 782 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CLN3Q13286 438 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF235Q14590 738 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CNGA3Q16281 694 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CERCAMQ5T4B2 595 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 DENND2CQ68D51 928 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PNCKQ6P2M8 343 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC14AQ86T13 490 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 JAMLQ86YT9 394 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CCNJLQ8IV13 435 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PGBD5Q8N414 524 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO39Q8N4B4 442 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 LZTR1Q8N653 840 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CCL4L1Q8NHW4 92 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HSPH1Q92598 858 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF599Q96NL3 588 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 BPIFA3Q9BQP9 254 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 STRADBQ9C0K7 418 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRN3Q9H3W5 708 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 NOD2Q9HC29 1040 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRK1Q38SD2 2015 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GTH6 734 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PQC6 194 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFRSF10CO14798 259 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 NOBOXO60393 691 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PEX11BO96011 259 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CPP00450 1065 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGA2BP08514 1039 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC5A2P31639 672 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM23P36406 574 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ARL4AP40617 200 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ETV3P41162 512 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF165P49910 485 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 INHBCP55103 352 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 DPYSL2Q16555 572 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms