RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 FRG2BQ96QU4 278 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 NUF2Q9BZD4 464 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 NUAK2Q9H093 628 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 KLC4Q9NSK0 619 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ANO10Q9NW15 660 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 DKK3Q9UBP4 350 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 IL17BQ9UHF5 180 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 NFS1Q9Y697 457 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TOPBP1Q92547 1522 aa4.77□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 XDHP47989 1333 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A087WV48 116 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF103O00237 685 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 OGG1O15527 345 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNJ1O43426 1573 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 CDKL5O76039 1030 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPOAP1O95153 1857 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL10O95999 233 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 GBAP04062 536 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2ABP04908 130 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TPM2P07951 284 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2ADP20671 130 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGAXP20702 1163 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 DRD4P21917 467 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 HSPA4P34932 840 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 LIMK1P53667 647 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 EPHB4P54760 987 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 CLDN2P57739 230 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 YPEL5P62699 121 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ECT2LQ008S8 904 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 NPRL3Q12980 569 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 RESTQ13127 1097 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 MLANAQ16655 118 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ME3Q16798 604 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 C6orf163Q5TEZ5 329 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 MFN1Q8IWA4 741 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMA8Q8TAA3 256 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 KAZALD1Q96I82 304 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 INTS14Q96SY0 518 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 COPG2Q9UBF2 871 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 IL19Q9UHD0 177 aa4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 OOEPA6NGQ2 149 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEB17A8MXT2 336 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 AHRRA9YTQ3 701 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP27B1O15528 508 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TLR2O60603 784 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 DAB1O75553 588 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 CELF2O95319 508 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 PCNAP12004 261 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TYMPP19971 482 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF8P28908 595 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP2J2P51589 502 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 GPC3P51654 580 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 ASIC1P78348 528 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 PGM5Q15124 567 aa4.75□□□□□ -1.65
CBX1P4-201ENST00000439415 DLG2Q15700 870 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms