RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMA1P23946 247 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADORA2BP29275 332 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCLMP48507 274 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNAR2P48551 515 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 LHX1P48742 406 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEK3P51956 506 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTTG1IPP53801 180 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 BECN1Q14457 450 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTF1Q14872 753 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF77Q15935 545 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF667Q5HYK9 610 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATL3Q6DD88 541 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ISM2Q6H9L7 571 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZRM9 215 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED25Q71SY5 747 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTL10Q7L3V2 364 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACOT1Q86TX2 421 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM186BQ8IYM0 893 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMTM8Q8IZV2 173 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADSSL1Q8N142 457 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCLK2Q8N568 766 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHFRQ96EP1 664 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC39A13Q96H72 371 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TWNKQ96RR1 684 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACBD6Q9BR61 282 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PACSIN1Q9BY11 444 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TASP1Q9H6P5 420 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPS4Q9NQG7 708 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 JKAMPQ9P055 326 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP25Q9UHP3 1055 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH9Q9ULB4 789 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB3Q9Y575 518 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP8B3O60423 1300 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PPL8 197 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDHR4A6H8M9 788 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANTXRLA6NF34 631 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHADO15335 359 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKAP3O75969 853 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAUS5O94927 633 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOBTB3O94955 611 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGFG2O95081 481 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF202O95125 648 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF20AO95235 890 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGF19O95750 216 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 EGFP01133 1207 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAX3P23760 479 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MXI1P50539 228 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 VAMP7P51809 220 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHN2P52757 468 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDST1P52848 882 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX8P57073 446 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 HHEXQ03014 270 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC6Q16204 474 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP221Q4G0U5 840 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBLN7Q53RD9 439 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf220Q5T0J3 134 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms