RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 NRF1Q16656 503 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ING5Q8WYH8 240 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 STARD8Q92502 1023 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 HAPLN3Q96S86 360 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 FUOMA2VDF0 154 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 MTMR11A4FU01 709 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 SNTNA6NMZ2 147 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 H0Y626 953 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 K7EPI3 171 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 IRAK2O43187 625 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 PRSS56P0CW18 603 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 GCAP28676 217 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 IRF9Q00978 393 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 KCNJ11Q14654 390 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TCEA2Q15560 299 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 NEDD8Q15843 81 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 FBXL22Q6P050 247 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 GAB3Q8WWW8 586 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 MARK4Q96L34 752 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 DACH2Q96NX9 599 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 SEMA3CQ99985 751 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TASP1Q9H6P5 420 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 RGS18Q9NS28 235 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 SCN4AP35499 1836 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 AIM2O14862 343 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 SIN3BO75182 1162 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 ZMPSTE24O75844 475 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 DGKIO75912 1065 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 CABYRO75952 493 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 F9P00740 461 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC25A3Q00325 362 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 PEX6Q13608 980 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 XKR5Q6UX68 686 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF366Q8N895 744 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 PHF21BQ96EK2 531 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 ING2Q9H160 280 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 TLK1Q9UKI8 766 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 CCL16O15467 120 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 GPR39O43194 453 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 SNAP91O60641 907 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 RAMP2O60895 175 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 HLA-DQB2P05538 268 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 CTPS1P17812 591 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 PTGS2P35354 604 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 COPAP53621 1224 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 FLOT2Q14254 428 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTBP13-201ENST00000423971 GPR107Q5VW38 600 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms