RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TNFP01375 233 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KELP23276 732 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCNCP24863 283 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VIPR1P32241 457 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIAA1024LP59773 190 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITKQ08881 620 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRAF2Q12933 501 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MESDQ14696 234 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARMC12Q5T9G4 340 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GKN2Q86XP6 184 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NAT6Q93015 286 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COQ10AQ96MF6 247 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSGA13Q96PP4 275 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CHP1Q99653 195 aa13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 A0A087WV48 116 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MATN3O15232 486 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KRT10P13645 584 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GM2AP17900 193 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MX2P20592 715 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CES1P23141 567 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRIM23P36406 574 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNGA3Q16281 694 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PNCKQ6P2M8 343 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 USP45Q70EL2 814 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RHOT2Q8IXI1 618 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC35F3Q8IY50 421 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NDUFAF2Q8N183 169 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC35G2Q8TBE7 412 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAML1Q92585 1016 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FATE1Q969F0 183 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAF2Q96CS3 445 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NUS1Q96E22 293 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCRN2Q96FV2 425 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SEMA3CQ99985 751 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WDR26Q9H7D7 661 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPTLC3Q9NUV7 552 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GULP1Q9UBP9 304 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AMACRQ9UHK6 382 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PADI4Q9UM07 663 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPIL1Q9Y3C6 166 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DGKBQ9Y6T7 804 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AKAP13Q12802 2813 aa13.39□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM202A6NGA9 273 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSMD11O00231 422 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TNFRSF10CO14798 259 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CSO75390 466 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAP3K6O95382 1288 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TGM2P21980 687 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KDELR1P24390 212 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGAP25P42331 645 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGEF7Q14155 803 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TCEA2Q15560 299 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL28A1Q2UY09 1125 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DENND2CQ68D51 928 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNGA4Q8IV77 575 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARL10Q8N8L6 244 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WDR48Q8TAF3 677 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR1E3Q8WZA6 343 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAPGEF5Q92565 580 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDXPQ96GD0 296 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNF157Q96PX1 679 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ANP32EQ9BTT0 268 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SIRPGQ9P1W8 387 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPR34Q9UPC5 381 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa13.38□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF487B1APH4 448 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BRINP1O60477 761 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 USP12O75317 370 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MTA2O94776 668 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDHA1P08559 390 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCNB1P14635 433 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CTPS1P17812 591 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CA4P22748 312 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LHCGRP22888 699 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ACTN2P35609 894 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EPHB1P54762 984 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GBE1Q04446 702 aa13.37□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PERM1Q5SV97 790 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms