RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDK4P11802 303 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTSEP14091 401 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NME1P15531 152 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD86P42081 329 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPL26P61254 145 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SHC2P98077 582 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RALGDSQ12967 914 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPP2R5EQ16537 467 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALG1LQ6GMV1 187 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MACC1Q6ZN28 852 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NT5DC3Q86UY8 548 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC112Q8NEF3 446 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LMX1AQ8TE12 382 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRT35Q92764 455 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUS1Q96E22 293 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NSMCE3Q96MG7 304 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OLFM3Q96PB7 478 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL12RB2Q99665 862 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DESI2Q9BSY9 194 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCNM1Q9BWG6 230 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HEMGNQ9BXL5 484 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LACRTQ9GZZ8 138 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR27Q9NS67 375 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SALL4Q9UJQ4 1053 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHKBQ9Y259 395 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H7C0C1 242 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCAMP1O15126 338 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AQP9O43315 295 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDHA1P08559 390 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C1SP09871 688 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CKMT2P17540 419 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP5OP48047 213 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MARCKSL1P49006 195 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NIPAL4Q0D2K0 466 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZBTB17Q13105 803 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NFATC4Q14934 902 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNGA3Q16281 694 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TAZQ16635 292 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLCO6A1Q86UG4 719 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM139Q8IV31 216 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HID1Q8IV36 788 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GALNT15Q8N3T1 639 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC25A45Q8N413 288 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LPCAT1Q8NF37 534 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR4C6Q8NH72 309 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARRDC2Q8TBH0 407 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCHCR1Q8TD31 782 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PIH1D2Q8WWB5 315 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GLMNQ92990 594 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HAUS1Q96CS2 278 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR92Q96MX6 357 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEP41Q9BYV8 373 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR26Q9H7D7 661 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UCKL1Q9NWZ5 548 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NLGN3Q9NZ94 848 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLQ9UEF7 1012 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPIL1Q9Y3C6 166 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR1A2Q9Y585 309 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0J9YYE9 177 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRID2IPA4D2P6 1211 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HACD1B0YJ81 288 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGAP6O43182 974 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SIGLEC6O43699 453 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRT86O43790 486 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FZD6O60353 706 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RFPL3O75679 317 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STK10O94804 968 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TJP3O95049 919 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RASGRP1O95267 797 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNFP01375 233 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRBC1P01850 177 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANXA6P08133 673 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALPIP09923 528 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSHRP16473 764 aa12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms