RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF135Q8IUD6 432 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TEX9Q8N6V9 391 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 OR13J1Q8NGT2 312 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CALML6Q8TD86 181 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PMM1Q92871 262 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 RAD9AQ99638 391 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ASAH2Q9NR71 780 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF358Q9NW07 568 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 VPS28Q9UK41 221 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TLK1Q9UKI8 766 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXO5Q9UKT4 447 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 MYO7AQ13402 2215 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 HELZP42694 1942 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 MROH6A6NGR9 719 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 HIDE1A8MVS5 230 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CCL16O15467 120 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 INSIG1O15503 277 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SNAP91O60641 907 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 DCTN3O75935 186 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TGDSO95455 350 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKCGP05129 697 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 GJA1P17302 382 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PRAMEP78395 509 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ARF5P84085 180 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PCLAFQ15004 111 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC14A2Q15849 920 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 FSCBQ5H9T9 825 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CFAP157Q5JU67 520 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 LINGO4Q6UY18 593 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PLPP6Q8IY26 295 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 OR6P1Q8NGX9 317 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF398Q8TD17 642 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 C7orf26Q96N11 449 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TSNARE1Q96NA8 513 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC37BQ96QE4 947 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC3Q9BY71 257 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CFAP97Q9P2B7 532 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC12A4Q9UP95 1085 aa10.04□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 LDB2O43679 373 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 NDST3O95803 873 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 GSRP00390 522 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PIRTP0C851 137 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CR2P20023 1033 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 BMPR1AP36894 532 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 AVPR1AP37288 418 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC7A9P82251 487 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 KLC1Q07866 573 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 STX3Q13277 289 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CYTH1Q15438 398 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PPM1LQ5SGD2 360 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CES4AQ5XG92 561 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 MBLAC2Q68D91 279 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA0408Q6ZU52 694 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CLEC14AQ86T13 490 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 DDI1Q8WTU0 396 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ERP27Q96DN0 273 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ELMO2Q96JJ3 720 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 VCX3BQ9H321 246 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 COPG2Q9UBF2 871 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CHKBQ9Y259 395 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 KCTD3Q9Y597 815 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 IRAK3Q9Y616 596 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ARL5AQ9Y689 179 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 C2orf71A6NGG8 1288 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CCL22O00626 93 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC7A4O43246 635 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 HAUS5O94927 633 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 STMN1P16949 149 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CSKP41240 450 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 C1QTNF8P60827 252 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 OCRLQ01968 901 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC12A1Q13621 1099 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 C10orf107Q8IVU9 208 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM217AQ8IXS0 508 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms