RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 OSER1Q9NX31 292 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 A0A1B0GVG6 124 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ARHGAP10A1A4S6 786 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 J3KR12 359 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TNFRSF10BO14763 440 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC26A3P40879 764 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ATP4BP51164 291 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC7A2P52569 658 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 NR1H2P55055 460 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CDKN2DP55273 166 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 LAMB3Q13751 1172 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 APOFQ13790 326 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CYTH1Q15438 398 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 HACD2Q6Y1H2 254 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DHFR2Q86XF0 187 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 L3HYPDHQ96EM0 354 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 C1orf74Q96LT6 269 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZNF597Q96LX8 424 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 HAUS8Q9BT25 410 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 OSBPL11Q9BXB4 747 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC2A11Q9BYW1 496 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PADI4Q9UM07 663 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CRYL1Q9Y2S2 319 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MYADML2A6NDP7 307 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PEX11BO96011 259 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PENKP01210 267 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC2A3P11169 496 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RHOQP17081 205 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ACADVLP49748 655 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ARSDP51689 593 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TUSC3Q13454 348 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 IKBKEQ14164 716 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MYLK3Q32MK0 819 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 USP41Q3LFD5 358 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MTX3Q5HYI7 312 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 GNASQ5JWF2 1037 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ARTNQ5T4W7 220 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RGMBQ6NW40 437 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TMEM207Q6UWW9 146 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 AMIGO2Q86SJ2 522 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PIM3Q86V86 326 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CLYBLQ8N0X4 340 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ROPN1LQ96C74 230 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 THEGQ9P2T0 379 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CD300AQ9UGN4 299 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TLR6Q9Y2C9 796 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 C7orf72A4D263 438 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 OR51F1A6NGY5 319 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 S1PR4O95977 384 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PAX3P23760 479 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CD52P31358 61 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TBX4P57082 545 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 HERVK_113P63132 956 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 KRT80Q6KB66 452 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CD300LGQ6UXG3 332 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ISCA2Q86U28 154 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 OR52K2Q8NGK3 314 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZFP28Q8NHY6 868 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ERVK-6Q9BXR3 956 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PADI3Q9ULW8 664 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD33BA6NCL7 494 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MROH6A6NGR9 719 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZNF839A8K0R7 811 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 NR5A2O00482 541 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 KPNA6O60684 536 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZNF623O75123 536 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ITGB1P05556 798 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 OR4Q2P0C623 313 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SPATA31D3P0C874 917 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms