RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PHF21BQ96EK2 531 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SPON1Q9HCB6 807 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D23Q9NUY8 699 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TCAF2A6NFQ2 919 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 GLTPD2A6NH11 291 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 KCNU1A8MYU2 1149 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 FUCA1P04066 466 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HOXC8P31273 242 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PTK2BQ14289 1009 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 AGAP9Q5VTM2 703 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SCN4BQ8IWT1 228 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ISOC1Q96CN7 298 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 OLFM1Q99784 485 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NT5MQ9NPB1 228 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 IGSF5Q9NSI5 407 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D13Q9NVG8 400 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA7Q9P0W8 599 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HS3ST4Q9Y661 456 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF37A1IGU5 675 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 IQCA1LA6NCM1 817 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 H3BNH8 94 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 GPR182O15218 404 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 GPC4O75487 556 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 OCM2P0CE71 109 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ARSAP15289 507 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 FGFR3P22607 806 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ACADVLP49748 655 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJB13P59910 316 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MAXP61244 160 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 DCDC5Q6ZRR9 648 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SCML4Q8N228 414 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 EME1Q96AY2 570 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 Q9Y3F1 56 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HEATR9A2RTY3 570 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 KCNA5P22460 613 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CD52P31358 61 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MANEALQ5VSG8 457 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 OGFOD2Q6N063 350 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SCD5Q86SK9 330 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 OR6P1Q8NGX9 317 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CALML6Q8TD86 181 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 OLAHQ9NV23 265 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 DSEQ9UL01 958 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MYRFQ9Y2G1 1151 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MYLKQ15746 1914 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SCN4AP35499 1836 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1W2PQH9 124 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 A8MT66 165 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 K7EPI3 171 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 IPO13O94829 963 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HOXC13P31276 330 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HTR7P34969 479 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CD86P42081 329 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 BCAP31P51572 246 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PSME3P61289 254 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 IRF5Q13568 498 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ATP1A4Q13733 1029 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SPIDRQ14159 915 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 AGKQ53H12 422 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TECRLQ5HYJ1 363 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 GPR180Q86V85 440 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SPPL2BQ8TCT7 592 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms