RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 WNT3AP56704 352 aa8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SULT2A1Q06520 285 aa8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 DPYSQ14117 519 aa8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 GRB7Q14451 532 aa8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ZNF410Q86VK4 478 aa8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 OR13C4Q8NGS5 318 aa8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 A8MT66 165 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 PTGESO14684 152 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 DAB1O75553 588 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 CD4P01730 458 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ZNF23P17027 643 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 CYP51A1Q16850 503 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 KDM1BQ8NB78 822 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 U3KQV3 271 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ZNF487B1APH4 448 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 J3QRK9 145 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ANGPT2O15123 496 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SH3BGRLO75368 114 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 GPR32O75388 356 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 TPPPO94811 219 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 KCNH1O95259 989 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ASLP04424 464 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 OXTRP30559 389 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ENTPD1P49961 510 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 IST1P53990 364 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 CDK18Q07002 472 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 LSAMPQ13449 338 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 PSMD5Q16401 504 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 INSCQ1MX18 579 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 CYS1Q717R9 158 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 TLK2Q86UE8 772 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 DHFR2Q86XF0 187 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 CASP10Q92851 521 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 FBXL8Q96CD0 374 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 RMDN1Q96DB5 314 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SP110Q9HB58 689 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 AASSQ9UDR5 926 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.9□□□□□ -0.98
THBS3-201ENST00000368378 OTOFQ9HC10 1997 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 FBP2O00757 339 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CABYRO75952 493 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ATP6V1B2P21281 511 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 FMO4P31512 558 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CDKN2DP55273 166 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CREB5Q02930 508 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PSMG2Q969U7 264 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PTPN18Q99952 460 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CASS4Q9NQ75 786 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 RGS18Q9NS28 235 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.89□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms