RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 CYTH2Q99418 400 aa11.67□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SPHK2Q9NRA0 654 aa11.67□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.67□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SEPT3Q9UH03 358 aa11.67□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.67□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 GOLGA8RI6L899 631 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 GYG2O15488 501 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SLC4A1P02730 911 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 KRT15P19012 456 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 MESP2Q0VG99 397 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 MPP3Q13368 585 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SIRPB2Q5JXA9 342 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SH2D4BQ5SQS7 431 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SORCS1Q8WY21 1168 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 LRRC39Q96DD0 335 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 EBF3Q9H4W6 596 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 EURLQ9NYK6 297 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 KCTD3Q9Y597 815 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PSAT1Q9Y617 370 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ASLP04424 464 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CCDC166P0CW27 439 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PFKLP17858 780 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 RHOAP61586 193 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 MAP7Q14244 749 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PTPRCAPQ14761 206 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 RANBP10Q6VN20 620 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 LINC00523Q86TU6 105 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 RASSF3Q86WH2 238 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 C12orf40Q86WS4 652 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 FIBINQ8TAL6 211 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 NAT14Q8WUY8 206 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF599Q96NL3 588 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PSKH2Q96QS6 385 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 AGAP2Q99490 1192 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 MGME1Q9BQP7 344 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 LHX3Q9UBR4 397 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 POLBP06746 335 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 GRM2Q14416 872 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SLC1A5Q15758 541 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PITRM1Q5JRX3 1037 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 TANGO2Q6ICL3 276 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 GPR149Q86SP6 731 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SPATA24Q86W54 205 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 FATE1Q969F0 183 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ASB16Q96NS5 453 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 NPHS2Q9NP85 383 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CLDND1Q9NY35 253 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CLEC1BQ9P126 229 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 MYLKQ15746 1914 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 HAUS5O94927 633 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CYP17A1P05093 508 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 INHBAP08476 426 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ITGA2BP08514 1039 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SERPINF2P08697 491 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 IGFBP4P22692 258 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 BMP8BP34820 402 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 TMPRSS15P98073 1019 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 GRIN2CQ14957 1233 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 STEAP4Q687X5 459 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms