RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 SAT1P21673 171 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTX3-201ENST00000295927 SERPINB4P48594 390 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 DMTNQ08495 405 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTX3-201ENST00000295927 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CARD16Q5EG05 197 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTX3-201ENST00000295927 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTX3-201ENST00000295927 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTX3-201ENST00000295927 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTX3-201ENST00000295927 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTX3-201ENST00000295927 C16orf46Q6P387 395 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PAF1Q8N7H5 531 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GPR150Q8NGU9 434 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTX3-201ENST00000295927 POLD2P49005 469 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 ZNF711Q9Y462 761 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 RAPH1Q70E73 1250 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 CHST14Q8NCH0 376 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 S1PR5Q9H228 398 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 ECT2Q9H8V3 914 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 HPS4Q9NQG7 708 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 TLK1Q9UKI8 766 aa22.87■■□□□ 1.25
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